Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tpm4Q6IRU2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Tpm4Q6IRU2 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tpm4Q6IRU2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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