Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Krt77Q6IFZ6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Krt77Q6IFZ6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms