Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Krt40Q6IFX3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt40Q6IFX3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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