Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms