Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms