Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sv2cQ69ZS6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Sv2cQ69ZS6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Sv2cQ69ZS6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sv2cQ69ZS6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Sv2cQ69ZS6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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