Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PtprdQ64487 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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