Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a5Q63ZW6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms