Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pabpc2Q62029 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Pabpc2Q62029 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc2Q62029 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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