Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga6Q61739 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms