Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ifi47Q61635 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ifi47Q61635 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms