Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxd1Q61345 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxd1Q61345 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms