Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mre11Q61216 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms