Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mkrn3Q60764 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms