Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
CttnQ60598 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CttnQ60598 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms