Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tsr1Q5SWD9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tsr1Q5SWD9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tsr1Q5SWD9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tsr1Q5SWD9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tsr1Q5SWD9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tsr1Q5SWD9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tsr1Q5SWD9 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms