Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms