Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms