Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc27a5Q4LDG0 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc27a5Q4LDG0 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Slc27a5Q4LDG0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Slc27a5Q4LDG0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Slc27a5Q4LDG0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Slc27a5Q4LDG0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Slc27a5Q4LDG0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Slc27a5Q4LDG0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc27a5Q4LDG0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms