Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx25Q3ZT31 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms