Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnpc3Q3UZ01 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnpc3Q3UZ01 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rnpc3Q3UZ01 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rnpc3Q3UZ01 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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