Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Pfdn4Q3UWL8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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