Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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