Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Usp19Q3UJD6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Usp19Q3UJD6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp19Q3UJD6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp19Q3UJD6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Usp19Q3UJD6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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