Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q3U6N9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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