Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LcorlQ3U285 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LcorlQ3U285 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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