Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms