Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ccndbp1Q3TVC7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms