Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc10Q3TLI0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc10Q3TLI0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms