Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Col24a1Q30D77 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col24a1Q30D77 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms