Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam178bQ24JP3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam178bQ24JP3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.1 ms