Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam171bQ14CH0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms