Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Ttc39dQ0VF76 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttc39dQ0VF76 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms