Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rundc1Q0VDN7 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms