Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Pou6f1Q07916 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms