Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MestQ07646 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MestQ07646 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MestQ07646 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms