Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
NrepQ07475 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms