Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
AmbpQ07456 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms