Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Prrx2Q06348 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms