Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GscQ02591 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GscQ02591 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms