Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ascl1Q02067 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms