Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mc1rQ01727 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms