Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EgfrQ01279 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms