Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pde1bQ01065 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms