Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rbp4Q00724 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rbp4Q00724 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms