Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GabpaQ00422 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms