Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pax8Q00288 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pax8Q00288 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms