Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Bop1P97452 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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