Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nbr1P97432 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms