Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms